Untuk mendukung program-program Yayasan memliki struktur organisasi yang bekerja secara terpadu dan berkesinambungan, meliputi:
A. Bidang Pengembangan dan Pendidikan
1. Pengembangan bidang pendidikan bagi relawan dan masyarakat yang berkecimpung di bidang kanker.
2. Membantu pemerintah dalam melaksanakan program Penanggulangan Kanker Terpadu Paripurna bekerjasama dengan organisasi lainnya untuk meningkatkan cakupan dan mutu pelayanan kesehatan.
3. Menyusun strategi dalam upaya meningkatkan upaya penanggulangan kanker secara terpadu, paripurna dan holistis dengan berlandaskan cinta kasih.
4. Meningkatkan SDM Yayasan dengan menyelenggarakan pelatihan-pelatihan secara teratur kepada pengurus maupun relawan.
B. Bidang Pelayanan dan Penyuluhan
1. Pelayanan kepada masyarakat, dimulai dan program penyuluhan dan penemuan dini.
2. Hospice Home Care, yaitu kunjungan rumah kepada penderita kanker terminal jika pengobatan sudah tidak dapat menghasilkan kesembuhan.
3. Reach to Recovery untuk meningkatkan kemampuan dan keterampilan sumber daya manusia yang memberikan pelayanan dalam bidang tersebut. merupakan suatu perkumpulan para eks pasien kanker yang memberikan informasi dan dukungan moril kepada pasien kanker yang baru didiagnosis dan atau sedang menjalani pengobatan.
4. Menyiapkan dan memberikan konseling termasuk konseling spiritual bagi pasien maupun keluarga pasien.
5. Menyelenggarakan darma wisata yang diikuti oleh pasien yang besera keluarganya.
6. Mengadakan bakti sosial dalam rangka penyebaran informasi tentang bahaya kanker dan cara-cara pencegahannya.
C. Bidang Organisasi dan Advokasi
1. Pengembangan organisasi baik intern maupun ekstern untuk dapat melaksanakan misi YMPK sebagai mitra Pemerintah dan masyarakat dalam penanggulangan kanker.
2. Pengembangan Organisasi secara ekstern dilakukan dengan membina kerjasama dengan sektor terkait baik di dalam maupun di luar negeri.
D. Bidang Penggalangan Dana dan Anggaran
1. Menyelenggarakan usaha penggalangan dana untuk membiayai kegiatan organisasi YMPK dapat berkembang secara kuantitas dan kualitas, dilaksanakan dengan berbagai upaya baik dari donatur tetap maupun donatur tidak tetap, melibatkan masyarakat luas secara terus menerus.
2. Dalam hal penggalangan dana, Yayasan memperoleh dana dari donatur tetap dan donatur tidak tetap. Selain itu, Yayasan juga mengadakan pengumpulan dana dengan cara menyelenggarakan bazar, undian berhadian, hiburan dan sebagainya
E. Bidang Kehumasan dan Hubungan Luar Negeri
1. Menjalin komunikasi dan mendapatkan informasi tentang upaya penanggulangan kanker di luar negeri.
2. Menjalin kerjasama dengan Media masa untuk menyebarluaskan program-program Yayasan.
3. Menjajagi kemungkinan bantuan luar negeri untuk kerja sama dengan Yayasan